Материалы по тегу: рск

19.11.2020 [13:31], Владимир Мироненко

SC20: в мировом рейтинге IO500 Россию представляют три суперкомпьютера РСК

На проходящей сейчас в онлайн-режиме всемирной суперкомпьютерной конференции SC20 была представлена новая редакция мирового рейтинга IO500 самых высокопроизводительных системам хранения данных HPC-класса, в которой единственными представителями России стали три суперкомпьютерные системы производства группы компаний РСК, ведущего отечественного разработчика решений для высокопроизводительных вычислений, ЦОД, облачных платформ и систем хранения данных.

Речь идёт о суперкомпьютере  МВС-10П  ОП2 (Межведомственный суперкомпьютерный центр Российской академии наук, МСЦ РАН), впервые попавшем в рейтинг и занявшем 18-е место, суперкомпьютере «Говорун» (22-е место, Объединённый институт ядерных исследований, ОИЯИ, Дубна) и суперкомпьютере «Политехник — РСК Торнадо» (28-е место, Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого, СПбПУ). В предыдущей редакции IO500 было два суперкомпьютера РСК.

Высокого результата удалось достичь благодаря применению во всех проектах технологии создания масштабируемых распределённых и компонуемых «по требованию» систем хранения данных RSC Storage on-Demand на основе NVMe-накопителей Intel SSD и Intel Optane SSD. Кроме того, в суперкомпьютере МСЦ РАН установлены новые узлы для хранения данных на базе высокоскоростных Intel SSD в форм-факторе E1.S.

МСЦ РАН — один из самых мощных российских суперкомпьютерных центров коллективного пользования в сфере науки и образования. После модернизации, проведенной специалистами РСК в течение 2020 года, пиковая производительность МВС-10П ОП2 выросла почти в два раза — на 93 %, достигнув 823,91 Тфлопс. 

Суперкомпьютер «Говорун» был создан в 2018 году при участи специалистов группы компаний РСК и корпорации Intel. В 2019 году он был модернизирован. Обновленная система обладает совокупной теоретической пиковой производительностью 860 Тфлопс двойной точности, являясь при этом гиперконвергентной программно- определяемой системой.

«Политехник – РСК Торнадо» является универсальным высокоплотным и энергоэффективным решением «РСК Торнадо» со 100 % жидкостным охлаждением на «горячей воде». После плановой модернизации, проведенной специалистами РСК в течение 2020 года, суммарная пиковая производительность вычислительных ресурсов СКЦ «Политехнический» в 2020 году выросла на 23 % и теперь составляет 1,6 Пфлопс.

Постоянный URL: http://servernews.ru/1025787
18.11.2020 [00:17], Владимир Мироненко

SC20: РСК представила all-flash СХД Tornado AFS с функцией высокой доступности

Группа компаний РСК, российский разработчик HPC-решений, представила на всемирной виртуальной суперкомпьютерной выставке SC20 целый ряд новых решений.

В частности, было объявлено, что высокоплотные и энергоэффективные вычислительные узлы «РСК Торнадо» будут поддерживать 10-нм серверные процессоры Intel с кодовым наименованием Ice Lake-SP, намеченные к выпуску в начале 2021 года. Как ожидается, новые чипы получат поддержку интерфейса PCI Express 4.0 и памяти Intel Optane DC второго поколения.

Также была представлена интеллектуальная СХД Tornado AFS с поддержкой функции высокой доступности для создания систем хранения с большим объемом данных. Решение отличается высокой надёжностью и доступностью данных благодаря объединению узлов Tornado AFS в функциональные пары, так как в случае выхода из строя одного из узлов работа обеспечивается с помощью второго.

Это обеспечивает надёжное хранение данных объёмом до 2 Пбайт в форм-факторе 2U с помощью 64-х NVMe SSD в форм-факторе E1.L. Также используются процессоры семейства Intel Xeon Scalable 2-го поколения, твердотельные диски Optane SSD и модули энергонезависимой PMem-памяти Optane DC Persistent Memory (DCPMM). В RSC Tornado AFS используется 100 % жидкостное охлаждение в режиме «горячая вода» с показателем эффективности использования электроэнергии PUE на уровне 1,04.

РСК подтвердила заявленную ранее поддержку DAOS в решениях RSC Storage on-Demand и объявила о переходе на обновлённую платформу оркестрации «РСК БазИС» для создания высокопроизводительных составных архитектур хранения данных. Это позволит вместо жёсткого регламентирования конфигурации применять компонуемый подход для управления DAOS. Использование высокопроизводительных адаптеров с поддержкой RDMA, NVMe-накопителей и памяти Optane DCPMM позволит произвести такую дезагрегацию и дальнейшую компоновку «по запросу» без снижения производительности.

Такой подход позволит заметно увеличить допустимый объем системы хранения данных благодаря отмене ограничений по объёму PMem в DAOS. При этом благодаря компонуемости, неиспользуемые в какой-то момент времени диски можно подключить к другому серверу на основе DAOS или Lustre. В дополнение можно разделить серверы с DAOS и серверы c NVMe-дисками на два пула, тем самым максимально устранив ограничения аппаратной архитектуры сервера (нехватку линий шины PCIe, используемой как накопителями, так и сетевыми адаптерами, а также физических ограничений шасси сервера по размещению дополнительных устройств и их охлаждению).

РСК также разработала пользовательский интерфейс для RSC Storage on-Demand, позволяющий быстро создать сложную многоуровневую компонуемую систему хранения «по требованию». Новый интерфейс поддерживает создание параллельных файловых систем Lustre, распределённых объектных систем хранения DAOS и их комбинаций.

Постоянный URL: http://servernews.ru/1025624
10.11.2020 [22:46], Игорь Осколков

FMS20: РСК объявила о поддержке Intel DAOS в своих СХД

Группа компаний РСК, российский разработчик HPC-решений, на Flash Memory Summit 2020 объявила о том, что её решения Data Storage-on-Demand теперь поддерживают Intel DAOS (Distributed Asynchronous Object Storage), высокопроизводительное объектное хранилище с открытым исходным кодом.

DAOS — это программно определяемое, горизонтально масштабируемое хранилище, специально созданное для HPC-нагрузок, которым требуется очень быстрая работа с очень большими объёмами данных. DAOS опирается на решения Intel PMDK и SPDK, которые позволяют напрямую взаимодействовать c «железом» в обход стандартных интерфейсов ОС и ядра, и использует только твердотельную память: NVMe SSD на базе NAND и Optane, а также PMem-модули Optane.

СХД RSC Tornado AFS

СХД RSC Tornado AFS

В портфолио РСК есть соответствующие программно-аппаратные решения. Гиперконвергентные узлы RSC Tornado HS на базе двух Intel Xeon Scalable второго поколения поддерживают установку до 12 NVMe-накопителей и технологию IMDT, что даёт до 24 Тбайт быстрого хранилища и до 4,2 Тбайт RAM на узел. Кроме того, компания обновила СХД RSC Tornado AFS — в 1U-шасси можно установить до 32 NVMe-накопителей EDSFF E1.L суммарной ёмкостью 1 Пбайт. Каждый узел также содержит два процессора Intel Xeon Scalable с поддержкой Optane DC Persistent Memory.

Как и во всех прочих узлах РСК, для СХД использует 100% охлаждение «горячей» водой. Для управления и оркестрации хранилищами предлагается готовый стек ПО РСК БазИС, позволяющий на лету формировать пулы хранения данных с необходимыми характеристиками.

Постоянный URL: http://servernews.ru/1025062
29.10.2020 [17:40], Игорь Осколков

Физика плазмы, добыча ископаемых, турбиностроение, астрофизика и космические корабли: суперкомпьютерный центр СПбПУ отмечает пятилетие

В конце 2014 года для Санкт-Петербургского политехнического университета Петра Великого (СПбПУ) были развёрнуты первые стойки суперкомпьютера «Политехник» на базе архитектуры «РСК Торнадо». В течение 2015 года создание суперкомпьютерного центра (СКЦ) было завершено, а в 2016-м мы там побывали и подробно рассказали о самой машине и инженерной инфраструктуре для ней.

На тот момент машина имела суммарную производительность 1,12 Пфлопс, однако за прошедшее время она получила несколько апгрейдов, нарастив пиковую теоретическую мощность до 1,6 Пфлопс. Сейчас «Политехник» включает процессоры Intel Xeon разных поколений и акселераторы Xeon Phi, NVIDIA Tesla V100 и K40.

Последнее обновление добавило 64 узла суммарной производительностью 300 Тфлопс + узлы, ориентированные на ИИ-нагрузки + новейшую гиперконвергентную систему хранения данных, что позволило машине занять 22 место в последнем рейтинге IO500. В TOP500 этой системы уже нет, а в TOP50 она занимает 4 (узлы «РСК Торнадо») и 58 (узлы «РСК Петастрим» с Xeon Phi) места. Всего в рейтинге есть 12 машин, созданных РСК.

Сегодня у СКЦ СПбПУ есть более 500 пользователей, входящих в сотню рабочих групп. Суммарно с момента запуска он обработал более 1,17 млн счётных задач, на которые пришлось 19 344 641 узло-час. Около трети мощностей используются внешними заказчиками. Это в основном организации и институты, которым необходимо провести расчёты, но нет возможности сделать их своими силами или же это попросту нецелесообразно по экономическим причинам.

Например, «ПетроТрейс», у которой есть во владении собственный кластер с пиковой мощностью 191,7 Тфлопс (25 место в TOP50), часть расчётов всё равно проводит именно на «Политехнике». Компания занимается обработкой и интерпретацией данных сейсмической разведки для нефтегазовой отрасли — современные методы геологоразведки позволяют быстрее и точнее находить месторождения, что ускоряет их разработку.

Из других практически важных работ можно отметить исследование лаборатории вычислительной гидроаэроакустики и турбулентности, выполненное по заказу РКК «Энергия». Работа касалась моделирования воздействий на пилотируемый космический корабль при его выведении на орбиту. Особенность таковых аппаратов в том, что они снабжены системой аварийного спасения экипажа — «игла» на навершии корабля имеет внутри реактивный двигатель, который и уводит капсулу с людьми в случае проблем на старте ракеты. Однако сопла этого двигателя меняют характер обтекания, что приводит к сильному воздействию на поверхность корабля.

Из, так сказать, классических прикладных инженерных HPC-задач есть расчёты различных турбин, турбинных установок и их компонентов: моделирование аэродинамической устойчивости лопаток паровых турбин, валидация теплового состояния охлаждаемых турбин ГТД, расчёт аэродинамической характеристики компрессора, оптимизация конструкции компрессора низкого давления для повышения его эффективности и так далее. Такого рода расчёты проводят довольно давно, так как строить макеты и проводить натурные испытания весьма накладно.

Ну а в случае фундаментальных исследований зачастую и вовсе невозможно. В частности, на машине СКЦ Высшей Инженерно-Физической Школой ИФНиТ проводились моделирования пристеночной плазмы термоядерного реактора, токамака. Такого рода установки и сами по себе сложны и нетривиальны, а уж задачи оптимизации для них крайне ресурсоёмки. В токамаке стоит задача создания и удержания плазмы в необходимом состоянии, при этом разница температур в пределах нескольких метров просто колоссальная — от миллионов градусов Кельвина для самой плазмы до почти нуля в системе сверхпроводящих обмоток электромагнитов, которые и удерживают плазму в нужной конфигурации.

Наконец, ещё одна типичная область для HPC — это астрофизика. Сотрудниками ФТИ им. А.Ф. Иоффе на суперкомпьютере СПбПУ проводится моделирование астрофизических объектов с экстремальным энерговыделением: изучаются модели пульсарных туманностей, ускорение частиц в остатках сверхновых, ударные волны в скоплениях галактик и, наконец, обтекание магнитосферы Земли солнечным ветром. Последнее имеет особое значение, так как учёные давно бьются над созданием хорошей модели магнитосферы, которая позволила бы заранее предсказать солнечные суперштормы.

Обо всём это было сегодня рассказано в рамках мероприятия, посвящённого пятилетию суперкомпьютерного центра СПбПУ. И это лишь малая часть научно-исследовательских и инженерных расчётов, которые проводятся на «Политехнике». Подробно ознакомиться с докладами можно на сайте мероприятия.

Постоянный URL: http://servernews.ru/1024143
30.09.2020 [09:36], Андрей Крупин

12 суперкомпьютеров РСК вошли в обновлённый рейтинг TOP 50 в России и СНГ

Группа компаний РСК заняла 24-процентную долю в новой редакции рейтинга TOP 50 самых мощных суперкомпьютеров России и СНГ. Иными словами, каждый четвёртый представленный в списке российский суперкомпьютер разработан и установлен специалистами РСК.

Всего в рейтинге фигурируют 12 вычислительных комплексов производства РСК. При этом три суперкомпьютера компании находятся в первой десятке этого списка (4-я, 6-я и 10-я позиции). В настоящее время суммарная пиковая производительность HPC-систем РСК в рейтинге TOP 50 превышает 4,63 Пфлопс.

Вычислительная система «Политехник — РСК Торнадо», установленная в суперкомпьютерном центре Санкт-Петербургского политехнического университета

Вычислительная система «Политехник — РСК Торнадо», установленная в суперкомпьютерном центре Санкт-Петербургского политехнического университета

В 2020 году РСК провела плановую модернизацию суперкомпьютеров в Санкт-Петербургском политехническом университете Петра Великого (СПбПУ) и Межведомственном суперкомпьютерном центре Российской академии наук (МСЦ РАН). Проведённые работы позволили увеличить пиковую производительность первой системы на 29 % до уровня 1,309 Пфлопс, а второй — почти в два раза (на 93 %) до 823,91 Тфлопс.

В сентябре этого года специалисты группы компаний РСК установили новую сверхкомпактную суперкомпьютерную систему класса «РСК микроЦОД» в Физико-техническом институте имени А.Ф. Иоффе Российской академии наук (ФТИ РАН, Санкт-Петербург), которая сразу же вошла в рейтинг TOP 50 и заняла 46-ю позицию с пиковой производительностью 92,16 Тфлопс.

Суперкомпьютер имени Н.Н. Говоруна в Объединенном институте ядерных исследований (ОИЯИ)

Суперкомпьютер имени Н.Н. Говоруна в Объединённом институте ядерных исследований (ОИЯИ)

Из других проектов компании в текущем списке TOP 50 присутствуют первый в мире гиперконвергентный суперкомпьютер «Говорун» в Объединённом институте ядерных исследований (11-я позиция), две вычислительные системы РСК в Южно-Уральском государственном университете (13-е и 31-е места), суперкомпьютер «РСК Торнадо — МФТИ» в Московском физико-техническом институте (44-я позиция), а также вычислительная система «НКС-1П» Сибирского суперкомпьютерного центра в Институте вычислительной математики и математической геофизики Сибирского отделения РАН, занимающая 50-е место.

РСК работает на рынке высокопроизводительных решений с 2009 года. Ключевыми заказчиками компании являются организации высшего образования (ведущие российские университеты) и науки, научно-исследовательские центры, лаборатории и конструкторские бюро.

Постоянный URL: http://servernews.ru/1021841
28.07.2020 [18:10], Алексей Степин

Российские суперкомпьютеры РСК попали в свежий рейтинг IO500

Виртуальный институт подсистем ввода-вывода (Virtual Institure for I/O, VI4IO) начал свою деятельность в 2016 году. Целью этой некоммерческой открытой организации стало предоставление платформы для обмена информацией в области исследований, касающихся I/O-подсистем суперкомпьютеров и кластерных систем. В этом году, по результатам проведённых исследований, VI4IO представила первый официальный рейтинг IO500, который обещает стать столь же популярным, как и TOP500 и Green500.

Официальный логотип нового рейтинга IO500

Теперь для попадания системы с IO500 существует стандартизированный набор правил и тестов, включающих в себя такие компоненты, как подтесты на чистую пропускную способность, на производительность при работе с метаданными и на скорость поиска в пространстве имён (namespace).

Сам набор тестов открытый, проект имеет собственный репозиторий на GitHub, там же содержится полная инструкция по запуску и получению результатов. Комплект IO500 построен на основе существующих популярных бенчмарков и имеет модульную структуру. Благодаря поддержке плагинов возможно тестирование различных альтернативных систем хранения данных.

Российские системы мы отметили красным

Российские системы мы отметили красным

Ранние результаты в официальный список IO500 не входят, поскольку с 2017 года правила менялись, но в нём присутствуют результаты с конференций SC19 и ISC 2020. Несмотря на все успехи ARM в сфере супервычислений, первое место в рейтинге всё же принадлежит Intel с её системой Wolf, способной развивать свыше 8,6 миллионов IOPS и продемонстрировавшей линейную скорость более 370 Гбайт/с. Высокое место занял и китайский комплекс Tianhe-2E, который также базируется на архитектуре x86.

Говорун стал отличаться ещё большим умом и сообразительностью после апгрейда 2018 года

В список попали и российские системы, разработанные, созданные и введённые в строй группой компаний РСК. Это гетерогенный суперкомпьютер «Говорун», установленный в ОИЯИ и одна из систем серии «Торнадо», располагающаяся в СПбПУ, занимающие 17 и 22 место соответственно. «Говорун» базируется на процессорных компонентах Intel Xeon Phi и Xeon Scalable в сочетании с узлами NVIDIA DGX-1 Volta. Система СПбПУ также имеет гетерогенную архитектуру, но в качестве ускорителей в ней применены NVIDIA Tesla K40X. В обоих случаях в качестве файловой системы используется Lustre.

С результатами IO500 можно ознакомиться на сайте проекта, там же есть и информация о том, как считается и формируется рейтинг.

Постоянный URL: http://servernews.ru/1016841
24.06.2020 [17:42], Алексей Степин

Новые HPC-решения РСК на ISC 2020: узлы Tornado, универсальная СЖО и SDS Lustre

Компания, а вернее, группа компаний РСК (RSC) — ведущий российский производитель суперкомпьютерных систем, чьи решения активно используются в борьбе с COVID-19. К примеру, не столь давно кластер суперкомпьютерного центра Российской академии наук «МВС-10П ОП» был модернизирован и получил новые вычислительные узлы на базе Xeon Scalable второго поколения.

Мимо такого мероприятия, как конференция ISC High Performance 2020 столь серьезный производитель пройти не мог и приурочил к проходящему ныне мероприятию анонс своих новых решений — как аппаратных модулей для создания систем класса HPC, так и программных новинок.

Разработкой и созданием суперкомпьютеров РСК занимается давно и присутствует на рынке с 2009 года, на её счету ряд инновационных решений. Плотность вычислений продолжает расти, растут потребляемые мощности, и отвечая на требования рынка, РСК уделяет самое пристальное внимание вопросам энергоэффективности, надёжности и простоты управления.

В рамках программно-определяемой платформы нового поколения компания представила на ISC 2020 свои новые разработки: вычислительные и гиперконвергентные узлы RSC Tornado, новые системы питания и программный комплекс RSC BasIS.

Компания экспериментировала с такой экзотикой, как процессоры Intel Xeon 9200, являющиеся, по сути, двумя Xeon 8200 под одной крышкой. Они были показаны на прошлой конференции SC19. Эта разработка Intel весьма специфична, так что современные вычислительные модули RSC Tornado Compute Node базируются на хорошо зарекомендовавших себя процессорах Xeon Scalable второго поколения с теплопакетами до 205 Ватт. Это либо серия Xeon Platinum 8200, либо Gold 6200; о более интересных Xeon Scalable третьего поколения (Cooper Lake) речи пока не идёт — они были представлены Intel совсем недавно.

Каждый модуль оснащается двумя процессорами, четырьмя планками Optane DCPMM общим объёмом до 2 Тбайт, двумя накопителями NVMe на базе Optane, а также двумя более медленными NVMe-накопителями Intel P4511 E1.S объёмом 4 Тбайт. «Малая» сетевая подсистема представлена двумя портами 10GbE, «большая» — портом Intel OmniPath 100 Гбит/с, InfiniBand EDR/HDR, либо портом 100GbE на усмотрение заказчика. Габариты модуля хорошо видны на слайде, где для сравнения размещён обычный карандаш.

В системе 100% жидкостного охлаждения как и прежде используется «горячий теплоноситель», это позволяет достичь высокой энергоэффективности — коэффициент PUE для новых модулей RSC Tornado не превышает 1,04. Вычислительная стойка с новыми модулями развивает до 0,7 Пфлопс, располагая 2,4 Пбайт пространства для хранения данных и скоростью их передачи в районе 2 Тбайт/с.

Гиперконвергентные модули RSC Tornado Hyper-Converged Node выполнены в том же стиле, но оптимизированы с учётом максимизации объёмов хранения данных. Благодаря использованию «линеечных» SSD каждый такой модуль может вмещать до 24 Тбайт в 12 NVMe-накопителях E1.S с «горячей заменой». Доступна поддержка Intel Memory Drive Technology (IMDT) с памятью ёмкостью до 4,2 Тбайт.

В качестве процессоров здесь также используются Xeon Scalable второго поколения. Сетевая часть даже более гибкая, нежели у вышеописанных вычислительных модулей: высокоскоростных интерфейсов Omni-Path, InfiniBand или Ethernet может быть два. RSC Tornado Hyper-Converged Node дают до 0,345 Пфлопс на стойку, но при этом объём хранимых данных достигает 3,6 Пбайт при скоростях передачи данных до 1,5 Тбайт/с.

В рамках единой системы охлаждаются гиперконвергентные модули так же, как и их чисто вычислительные собратья, и эффективность такого охлаждения столь же высока. Конструкция унифицированной вычислительной 42U-стойки с единой системой жидкостного охлаждения, занимающей всего 0,64 м2, позволяет установить любые узлы РСК количеством до 153 шт. Блоки питания выполнены в том же форм-факторе, что и остальные узлы.

Даже 3,6 Пбайт на стойку может оказаться мало, и на этот случай РСК представила новые модули хранения данных. В них устанавливается до 32 накопителей Intel E1.L в формате EDSFF, поэтому легко достигаются объёмы порядка 1 Пбайт на узел. В пересчёте на стойку это дает до 42 Пбайт, производительность таких «дисковых модулей» может достигать 0,8 Тбайт/с. Для ускорения работы используются модули Intel Optane DCPMM.

РСК активно продвигает использование жидкостного охлаждения. Наряду с «горячим теплоносителем» в новых модульных системах компания впервые предлагает готовые модули модернизации для стандартных серверов, что позволяет их перевести на использование жидких теплоносителей. Новые водоблоки полностью совместимы с существующими креплениями и легко заменяют воздушные радиаторы.

Каждый водоблок РСК может отвести до 400 Ватт тепла. Системы жидкостного охлаждения разработки РСК позволяют удалить за пределы сервера до 70% всего выделяемого тепла, что даёт возможность отключить системные вентиляторы и снизить за счёт этого энергопотребление. Надёжность гарантирует и тот факт, что теплоносители, применяемые РСК в этих системах, электрически инертны и в случае утечки не повредят оборудование.

Комплекс охлаждения РСК состоит из водоблоков, модуля распределения теплоносителя (крепится к стандартной стойке), насосного модуля. На входе стойка потребляет жидкость с температурой от 45 до 55 градусов Цельсия, на выход идёт среда с температурой 55 градусов. Теплообменник в насосном блоке передаёт тепло (50 градусов) на внешний контур кондиционирования. На вход же от внешнего контура приходит носитель с температурой в районе 23 ‒ 45 градусов.

По сравнению с традиционными воздушными комплексами охлаждения говорится о снижении стоимости эксплуатации на величину до 70%. За счёт уменьшения количества вентиляторов в серверах и кондиционерах обеспечивается дополнительная экономия электроэнергии, а пространство в ЦОД используется более эффективно: там, где раньше можно было рассеивать до 12 киловатт тепла, теперь рассеивается до 50 кВт. Кроме того, имеется возможность использования выделяемого тепла для других целей, например, для отопления соседних помещений.

О непревзойденной эффективности речи не идёт, но 50 кВт на стойку — это выше, нежели у аналогичных открытых решений (36 кВт на стойку) или решений, используемых Большой Семёркой облачных провайдеров. Погружные системы и системы прямого контакта могут давать от 150 до 400 кВт на стойку, но либо стоят существенно дороже и требуют специального оборудования, либо гораздо сложнее в эксплуатации и обслуживании при сравнимом показателе PUE.

С совместимостью у новых систем распределения теплоносителя РСК всё хорошо: они могут работать как с водоблоками собственной разработки, так и с решениями Asetek и CoolIT, а также с любыми стоечными серверами стандартной конфигурации.

В программной части группа РСК представила новый программно-определяемый комплекс BasIS. Он может работать как на платформах самой РСК, так и на любом стандартном аппаратном обеспечении. Большое внимание уделено как эффективности нового ПО, так и удобству и простоте управления. Система BasIS легко масштабируется по мере наращивания количества вычислительных узлов.

Пространство для хранения данных пользователя выделяется динамически, в режиме «storage on demand». Основой является широко распространённая в мире высокопроизводительных вычислений открытая распределённая файловая система Lustre, впервые представленная ещё в 2003 году. «Lustre on demand» используется, например, в суперкомпьютере РСК, установленном в Объединённом институте ядерных исследований в Дубне.

Можно сказать, что группа РСК очень хорошо понимает требования к HPC-системам сегодняшнего дня и предлагает современные, универсальные и качественно спроектированные решения, как в аппаратной, так и в программной части.

Постоянный URL: http://servernews.ru/1014165
02.06.2020 [00:24], Алексей Степин

К суперкомпьютерному проекту The Good Hope Net для борьбы с коронавирусом присоединились китайские университеты

Мы уже рассказывали о том, что машина «МВС-10П ОП» Межведомственного суперкомпьютерного центра Российской академии наук (МСЦ РАН) будет задействована для борьбы с COVID-19 в рамках международного проекта.

Теперь же МСЦ РАН объявил о достижении соглашения с тремя китайскими высшими учебными заведениями: Университетом Хунаня, Шанхайским университетом Цзяотун и Университетом Сямыня.

В результате международная исследоватальская группа The Good Hope Net пополнилась новыми участниками. К суперкомпьютеру получили доступ не только российские и китайские учёные, но также их финские, итальянские, канадские коллеги. Цель — исследование взаимодействия пепломеров (выступов на теле вирусной частицы) коронавирусов с человеческим белком АПФ2.

Сам суперкомпьютер «МВС-10П ОП» недавно претерпел модернизацию. Он получил новые вычислительные узлы с процессорами Intel Xeon Scalable второго поколения. В результате пиковая производительность возросла до 771 Тфлопс, а суммарная мощность всех систсем МСЦ РАН превышает на текущий момент 1,3 Пфлопс. Симуляция поведения белков при их взаимодействии — весьма ресурсоёмкая задача, так что 209 Тфлопс производительности, полученные в результате апгрейда, лишними явно не будут. 

Постоянный URL: http://servernews.ru/1012391
26.03.2020 [14:51], Андрей Крупин

Суперкомпьютер МСЦ РАН задействуют для борьбы с коронавирусом

Межведомственный суперкомпьютерный центр Российской академии наук (МСЦ РАН) задействует ресурсы вычислительного комплекса «МВС-10П ОП» для моделирования биохимических процессов и разработки лекарственных препаратов против коронавирусной инфекции COVID-19.

Суперкомпьютер «МВС-10П ОП» разработан группой компаний РСК и используется в составе вычислительных систем МСЦ РАН с 2017 года. В основу комплекса положена кластерная система на базе архитектуры «РСК Торнадо» с прямым жидкостным охлаждением. В конце 2019 года суперкомпьютер был модернизирован, в результате чего его пиковая производительность достигла 771 Тфлопс. Значительного прироста мощности в 209 Тфлопс удалось достичь благодаря добавлению нового сегмента на базе высокопроизводительных процессоров Intel Xeon Scalable второго поколения.

Вычислительные ресурсы «МВС-10П ОП» будут использованы российскими учёными в кооперации с зарубежными коллегами из Финляндии, Китая, Японии и Канады в рамках реализации проекта по разработке медицинских препаратов для диагностики и терапии инфекционного заболевания COVID-19.

«Идея нашего проекта — с помощью методов молекулярного моделирования сделать компьютерный «дизайн» медицинского препарата, избирательно взаимодействующего с рецептор-связывающим доменом Spike-белка коронавируса штамма SARS-CoV-2. Самые перспективные агенты специфического связывания будут использованы для диагностики (идентификации вирусных частиц в слюне), а также для разработки противовирусных средств, блокирующих инфицирование. Результаты теоретических расчётов и компьютерного моделирования затем будут проверены экспериментально на белках, вирусах и клетках», — говорят исследователи, подчёркивающие, что поиск способов предотвращения или снижения негативных последствий от коронавирусной инфекции сегодня является приоритетным направлением научных исследований.

Постоянный URL: http://servernews.ru/1006886
19.11.2019 [23:32], Андрей Созинов

SC19: РСК представила Tornado AP на базе Xeon 9200 и All-Flash СХД ёмкостью 1 Пбайт в 1U (Обновлено)

Российский разработчик суперкомпьютеров РСК представил в рамках конференции SC19 новые вычислительные узлы Tornado AP, а также новые All-Flash системы хранения данных большой ёмкости.

Новинки выделяются в первую очередь тем, что за отвод тепла в них полностью отвечают системы жидкостного охлаждения.

Вычислительный узел Tornado AP построен на серверной платформе Intel S9200AP с парой высокопроизводительных процессоров Xeon Platinum 9200-й серии. Напомним, что данные процессоры выполнены в корпусе BGA, то есть распаяны прямо на материнской плате, и способны предложить от 32 до 56 ядер. Производительность одного узла Tornado AP может достигать весьма внушительных 9 Тфлопс.

Что касается системы хранения данных Tornado All-Flash, то, как нетрудно догадаться по названию, она построена на твердотельных накопителях. Здесь использованы твердотельные накопители Intel SSD D5-P4326, выполненные в «линеечном» форм-факторе (Ruler). Всего СХД вмещает до 32 «линеек» общим объёмом до 1 Пбайт. В основе системы лежит пара процессоров Intel Xeon Scalable второго поколения и память Intel Optane DC Persistent Memory.

Как в вычислительной системе Tornado AP, так и в системе хранения данных Tornado All-Flash используется фирменная система охлаждения горячей водой РСК, которая, по словам производителя, позволяет достичь высокой энергетической плотности и эффективности. Также это обеспечивает бесшумную работу системы.

Обновление от 29.11:

РСК раскрыла новые подробности о новинках, представленных в рамках SC19. Касательно вычислительных систем Tornado AP было отмечено, что они могут нести в себе до 1,5 Тбайт оперативной памяти и до двух твердотельных NVMe-накопителей.

Причём это могут быть либо накопители формата M.2, например, Intel Optane SSD DC P4801X или Intel SSD DC P4511 (M.2), либо «линеечные» накопители, например, Intel SSD DC P4511 (E1.S). Также опционально предлагается расширенное хранилище данных с шестью накопителями E1.L, каждый объёмом до 15,36 Тбайт. Это даёт более 100 Тбайт скоростной памяти для хранения данных.

Российский разработчик отмечает, что с помощью высокопроизводительных и компактных машин Tornado AP в рамках одного монтажного шкафа 42U можно создавать систему с суммарной пиковой производительностью в 0,8 Пфлопс и с хранилищем данных на 8,4 Пбайт. 

Что касается систем хранения данных Tornado AFS (All-Flash System), то здесь было отмечена поддержка технологии NVMe-over-Fabric (NVMe-oF), которая обеспечивает скоростное подключение СХД к другим узлам системы. Также отметим, что новинка может комплектоваться адаптерами с различными интерконнектами со скоростью передачи данных до 200 Гбит/с, включая Intel Omni-Path, InfiniBand и Ethernet. На базе Tornado AFS можно получить хранилище со скоростью работы несколько Тбайт/с и ёмкостью до 20,64 Пбайт на шкаф. 

Обновление получила и гиперконвергентная СХД RSC Tornado HS с 12 NVMe-накопителями. Она получила поддержку памяти Intel Optane DCPMM, что позволит использовать программный стек Intel DAOS. Именно такие решения в ходе модернизации суперкомпьютера имени Н.Н. Говоруна в Объединенном институте ядерных исследований позволили достичь производительности распределенной системы хранения данных в 300 ГБайт/c. 

Кроме того, РСК провела унификацию форм-фактора монтажного шкафа, включая «распределенную систему энергопитания с дублированием N+x, встроенную систему мониторинга и управления вычислительной и коммутационной компонентами», что позволит совмещать в одной стойке как собственные решения РСК со 100% жидкостным охлаждением, так любое другое стандартное 19" оборудование сторонних вендоров, оснащённое воздушной или гибридной СО. 

Постоянный URL: http://servernews.ru/998020
Система Orphus