Материалы по тегу: компьютер

02.06.2020 [00:24], Алексей Степин

К суперкомпьютерному проекту The Good Hope Net для борьбы с коронавирусом присоединились китайские университеты

Мы уже рассказывали о том, что машина «МВС-10П ОП» Межведомственного суперкомпьютерного центра Российской академии наук (МСЦ РАН) будет задействована для борьбы с COVID-19 в рамках международного проекта.

Теперь же МСЦ РАН объявил о достижении соглашения с тремя китайскими высшими учебными заведениями: Университетом Хунаня, Шанхайским университетом Цзяотун и Университетом Сямыня.

В результате международная исследоватальская группа The Good Hope Net пополнилась новыми участниками. К суперкомпьютеру получили доступ не только российские и китайские учёные, но также их финские, итальянские, канадские коллеги. Цель — исследование взаимодействия пепломеров (выступов на теле вирусной частицы) коронавирусов с человеческим белком АПФ2.

Сам суперкомпьютер «МВС-10П ОП» недавно претерпел модернизацию. Он получил новые вычислительные узлы с процессорами Intel Xeon Scalable второго поколения. В результате пиковая производительность возросла до 771 Тфлопс, а суммарная мощность всех систсем МСЦ РАН превышает на текущий момент 1,3 Пфлопс. Симуляция поведения белков при их взаимодействии — весьма ресурсоёмкая задача, так что 209 Тфлопс производительности, полученные в результате апгрейда, лишними явно не будут. 

Постоянный URL: http://servernews.ru/1012391
29.05.2020 [12:50], Владимир Мироненко

Консорциум COVID-19 HPC Consortium расширил присутствие в Европе

В четверг, 28 мая, на виртуальном совещании министров науки стран-членов «Большой семерки» (Group of Seven, G7) было объявлено о присоединении Великобритании к консорциуму COVID-19 HPC Consortium. Координировать участие британской стороны в проекте, благодаря которому его мощности вырастут более чем на 20 петафлопс, будет неправительственная организация UK Research and Innovation (UKRI).

COVID-19 HPC Consortium — частно-государственная инициатива, предоставляющая бесплатный доступ к обработке высокопроизводительных вычислений учёным, занимающимся поиском действенных средств борьбы с коронавирусом с использованием технологий на основе искусственного интеллекта.

Компания IBM, которая в марте этого года помогла сформировать консорциум вместе с Управлением науки и технологий Белого дома и Министерством энергетики США, опубликовала обновлённую информацию о расширении программы и ее исследовательской работе.

Сообщается, что члены европейской суперкомпьютерной ассоциации PRACE (Partnership for Advanced Computing in Europe) обязались предоставить проекту доступ к своим суперкомпьютерным платформам, включая Piz Daint Швейцарского национального суперкомпьютерного центра, шестому по величине суперкомпьютеру в мире, согласно рейтингу Топ-500.

В свою очередь, UK Research and Innovation (UKRI) предоставит три своих суперкомпьютера, в том числе ARCHER, систему в 2,55 петафлопс в Эдинбургском университете, а также мощности правительственного агентства Science and Technology Facilities Council (STFC) DIRAC и Института Эрлхэма (Норидж) Научно-исследовательского совета по биотехнологиям и биологическим наукам (BBSRC).

«COVID-19 — глобальная проблема, поэтому важно, чтобы мы запустили инструменты для её решения в как можно больше мест по всему миру, — заявил Дейв Турек (Dave Turek), вице-президент IBM по техническим вычислениям. — Вот почему, несмотря на то что консорциум возник в США, мы сосредоточены на добавлении участников из других регионов, чтобы обеспечить изыскания с использованием суперкомпьютеров везде, где это необходимо исследователям».

В COVID-19 HPC Consortium теперь входит более 56 команд исследователей, имеющих доступ к суперкомпьютерам с суммарной производительностью 430 петафлопс.

Постоянный URL: http://servernews.ru/1012154
26.05.2020 [16:16], Владимир Мироненко

Лишь половина стран EuroHPC готова участвовать в финансировании  HPC-проектов

Из 32 стран, участников совместного предприятия «EuroHPC JU» (European High Performance Computing Joint Undertaking) со штаб-квартирой в Люксембурге, лишь 16 подтвердили намерение участвовать в софинансировании проектов EuroHPC, намеченных на 2020 год.

Ранее ещё один активный участник проекта, Великобритания, вышел из состава EuroHPC в связи с Brexit'ом. 

Две страны — Нидерланды и Эстония — уже заявили, что не собираются финансировать какую-либо деятельность EuroHPC. Другие страны пока не озвучили свою позицию по этому поводу. Между тем первый взнос в проекты необходимо внести в июле 2020 года. Подготовка предложений для реализации проектов будет очень сложной для заявителей, поскольку те не знают, на какое финансирование они могут располагать.

Среди всех 32 стран, участников EuroHPC, Нидерланды, являющиеся одной из 7 стран, инициировавших Декларацию EuroHPC в марте 2017 года, оказались единственной страной, не принявшей участия ни в одном проекте EuroHPC.

Для организаций из Нидерландов, занятых в сегменте высокопроизводительных вычислений (HPC), это означает, что им придётся самим оплачивать 50 % своего участия в проектах, которое не будет финансироваться из бюджета EuroHPC. Вместе с тем организации в других странах получат для участия в проектах 50 % средств из национальных фондов.

В рамках EuroHPC, в частности, планируется создание 3 суперкомпьютеров преэкзафлопсного класса и 5 суперкомпьютеров петафлопсного уровня. Предполагается, что половину средств на проекты выделит фонд EuroHPC, а вторую внесут страны-участницы. 

Постоянный URL: http://servernews.ru/1011874
22.05.2020 [12:52], Юрий Поздеев

Суперкомпьютер LUMI будет отапливать дома местных жителей

Loiste Lämpö и CSC - IT Center for Science Ltd подписали соглашение об отведении тепла от центра обработки данных в городскую теплосеть. Новый дата-центр будет закончен в 2021 году и в нем планируют разместить суперкомпьютер LUMI.

Loiste Lämpö – компания, предоставляющая услуги централизованного отопления в домах Каяани. В этом финском городе живет чуть больше 38 тыс. человек. 

фото со строительства дата-центра (lumi-supercomputer.eu)

Фото со строительства дата-центра (lumi-supercomputer.eu)

Суперкомпьютер LUMI является совместным проектом EuroHPC и девяти европейских стран с объемом инвестиций более 200 миллионов евро. Половина финансирования поступает от Европейского Союза, а половина от стран-участниц.

В свете последних экологических инициатив в Европе, новый дата-центр строится максимально эко-эффективным, отвод тепла в систему центрального отопления — это еще один фактор снижения влияния на окружающую среду и уменьшение выбросов СО в атмосферу за счет того, что вместо отдельных котельных в каждом доме будет использована единая тепломагистраль.

архитектура суперкомпьютера LUMI (lumi-supercomputer.eu)

Архитектура суперкомпьютера LUMI (lumi-supercomputer.eu)

Суперкомпьютер LUMI будет использоваться для проведения исследований в области материаловедения, биосинтеза, фармацевтики и глобального изменения климата. Теоретическая пиковая производительность LUMI составит более 200 петафлопс, что примерно в 10 раз больше, чем у самого быстрого в Европе суперкомрьютера Piz Daint.

Основой машины являются узлы с графическими ускорителями Nvidia. Lumi будет иметь хранилище ёмкостью более 60 Пбайт. Примерно 5 Пбайт из этого объема будет построено на SSD-накопителях, что позволит достигнуть пропускной способности более 1 Тбайт/с. Для вычислений и проектирования будут использоваться в том числе такие приложения, как Jupyter Notebooks, Rstudio и Matlab.

Как будет развиваться проект покажет время, однако уже с 2021 года жители города Каяни смогут выбирать в качестве метода отопления «чистое» центральное отопление, произведенное с учетом отведенного от дата-центра тепла. 

Это не единственный проект такого рода. Например, в той же Финляндии новый ЦОД компании Яндекс был спроектирован таким образом, что тепло от него отдавалось в городскую теплосеть. У Facebook и Asetek есть аналогичные проекты в Дании

Постоянный URL: http://servernews.ru/1011573
20.05.2020 [23:01], Алексей Степин

ARM-суперкомпьютер Fujitsu Fugaku запущен досрочно для помощи в борьбе с COVID-19

Суперкомпьютеры нередко используются в химических и биологических исследованиях; последние часто имеют целью нахождение способов лечения различных заболеваний, из которых на сегодня самым актуальным является COVID-19. Мы уже рассказывали о том, что будущий японский флагман супервычислений, машина Fugaku, включится в борьбу с эпидемией.

Сейчас стали известны некоторые любопытные факты, касающиеся этого проекта. Интереснее всего, конечно, то, что Fugaku смонтирован с опережением всех планов — система уже установлена и в настоящее время вводится в строй, дабы присоединиться к вычислительной армии, сражающейся на поле битвы с коронавирусом.

Это последний суперкомпьютер, базирующийся на традиционной архитектуре с применением только CPU. В разработке Fujitsu, напоминаем, используются процессоры A64FX. Они имеют доработанную архитектуру ARM (v8.2), усиленную 512-битными блоками векторных вычислений SVE, чем идеологически напоминают Xeon Phi. 

Прототип вычислительного модуля Fujitsu на базе A64FX

Прототип вычислительного модуля Fujitsu на базе A64FX

К сожалению, такой подход сказывается на общей эффективности проекта: разогнать его до производительности на уровне экзапфлопа технически реально. На это требуется порядка 60 ‒ 80 МВт и от 1,5 до 2 миллиардов долларов. Бюджет проекта на его начало в 2016 году составлял примерно $910 миллионов (110 миллиардов японских иен). Первоначальная оценка производительности Fugaku, напомним, составляет порядка 400 Пфлопс при потреблении 30 ‒ 40 МВт.

Правда, достижение экза-класса и не было целью Fugaku, как отметил директор директор Центра компьютерных наук RIKEN, Сатоши Мацуока (Satoshi Matsuoka). В качестве задачи ставилось стократное ускорение в сравнении с предыдущим суперкомпьютером RIKEN, машиной K, с производительностью 10,51 Пфлопс.

Процессор A64FX

Процессор A64FX содержит в себе память HBM2 и контроллер межсоединений Tofu

Следует отметить, что ни RIKEN, ни Fujitsu изначально не ставили задачи достижения «чистого» экзафлопа, на вычислениях двойной точности (FP64). Тем не менее, последние оценки производительности Fugaku выглядят даже лучше, чем прошлогодние.

Машина на данный момент состоит из 400 стоек и располагает 158 976 процессорами A64FX, каждый из которых имеет 48 основных и 4 вспомогательных ядра и работает на частоте 2,2 ГГц. На операциях типа INT8 Fugaku развивает 4,3 экзаопа, в более привычных единицах FP16 (половинная точность) результат также вызывает уважение — 2,15 экзафлопа. Но, повторимся, удельная производительность у Fugaku не рекордная.

Хотя производительность в INT8 хороша сама по себе и ненамного ниже производительности суперкомпьютера Saturn V, использующего различные ускорители NVIDIA Tesla от P100 до A100. Но при равных 4,3 экзаопах затраты на машину типа Saturn V составят всего 860 серверов и $171 миллион. Это в 5,3 раза дешевле Fugaku. Впрочем, когда речь заходит о простоте программирования, решение Fujitsu выигрывает.

Характеристики Fujitsu A64FX

Характеристики Fujitsu A64FX

Цифры в режимах FP32 и FP64 скромнее, они составляют 1,07 экзафлопс и 537 петафлопс соответственно, что, впрочем, всё равно достаточно серьёзный показатель. Общий объём оперативной памяти составляет 4,85 Пбайт, причём это быстрая память HBM2 с пропускной способностью более 1 Тбайт/с. Совокупная же скорость составляет внушительные 163 Пбайт/с.

Зарубежные обозреватели, в частности, Next Platform, не без оснований считают Fugaku сбалансированной машиной, сочетающей в себе в нужных пропорциях вычислительную мощность, производительность системы межсоединений и пропускную способность оперативной памяти.

Не всё так плохо даже с удельной производительностью: прототип Fugaku в прошлом году показал 16,78 Гфлопс на Ватт, что оказалось быстрее кластеров на базе Tesla V100 с их пиковыми 15,77 Гфлопс на Ватт, и тем более, быстрее «чистых» систем на базе Xeon SP Gold с 5,84 Гфлопс на Ватт. Скорее всего, NVIDIA с выпуском A100 возьмёт реванш, особенно на вычислениях двойной точности и возглавит первое место в рейтинге Green500, но Fugaku, как только пройдёт финальные тесты, ответит на это доминированием в HPCG и Graph500.

Fujitsu A64FX: лебединая песнь традиционных супервычислений?

Fujitsu A64FX: лебединая песнь традиционных супервычислений?

Тем не менее, очевидно, что будущее за гибридными решениями, сочетающими в себе ЦП, ГП и иные специализированные ускорители. Более точно об этом можно будет рассказать в 2021 году, когда Fugaku выйдет на полную мощность официально. В настоящее время, как уже было сказано, он находится в процессе подключения к битве против COVID-19. Это будет серьёзное подспорье и остаётся лишь похвалить Fujitsu, сумевшую досрочно запустить столь серьёзный проект, несмотря на все проблемы с логистикой и производством, которые были вызваны эпидемией.

На Fugaku запущено уже пять проектов, связанных с COVID-19. Среди них симуляция воздушно-капельных процессов заражения, поиск кандидатов в лекарства против коронавируса, анализ белков SARS-CoV-2, статистический анализ распространения заболевания в Японии, а также оценка влияния эпидемии на экономику страны в период карантина.

Постоянный URL: http://servernews.ru/1011455
19.05.2020 [18:00], Игорь Осколков

Microsoft создала облачный суперкомпьютер для ИИ

На проходящей сейчас конференции Build 2020 компания Microsoft объявила о создании суперкомпьютера на базе Azure, производительность которого, как заявлено, достаточна для того, чтобы попасть в пятёрку лидеров рейтинга TOP-500. Новая машина была развёрнута в Microsoft Azure эксклюзивно для проекта OpenAI, о сотрудничестве с которым было объявлено в прошлом году.

Суперкомпьютер ориентирован на обучение сверхтяжёлых ИИ-моделей следующего поколения.

В частности, корпорация имеет собственное семейство таких моделей, Microsoft Turing models, куда входит и самая крупная из существующих сейчас языковая модель Turing Natural Language Generation (T-NLG), включающая 17 млрд параметров. Обучение такой модели — процесс весьма затратный.

В сообщении компания не приводит точную конфигурацию нового суперкомпьютера, говоря лишь о том, что у него имеется более 285 тыс. ядер CPU, 10 тыс. GPU и 400Gb-интерконнект. В Microsoft Azure есть несколько вариантов HPC-инстансов. Например, в основе NDv2 лежат машины, несущие 8 ускорителей NVIDIA Tesla V100, которые можно объединять в кластеры. Заказчикам доступны кластера из 100 таких машин, объединённых InfiniBand. Есть в Azure и другие ускорители — инстансы NDv3 используют системы с восемью картами Graphcore C2.

Напомним, что на прошлой неделе NVIDIA вместе с анонсом ускорителей A100 на базе архитектуры Amper сообщила, что её собственный ИИ-суперкомпьютер SATURN V пополнился четырьмя системами Superpod, каждая из которых состоит из 140 машин DGX A100. Суммарная производительность в ИИ-задачах достигает фантастических 5 экзафлопс. Впрочем, на «классических» FP64-вычислениях обновление платформы даёт 93 Пфлопс в пике. Этого тоже хватит, чтобы попасть в Топ-5 нынешнего списка TOP-500. Кроме того, SATURN V на самом деле не является единой системы — он разбит на кластеры, находящиеся в четырёх разных местах.

Постоянный URL: http://servernews.ru/1011312
15.05.2020 [20:57], Алексей Степин

Atos анонсировала первый суперкомпьютер с ускорителями NVIDIA Ampere

Один из крупнейших и наиболее известных в мире производителей суперкомпьютеров, компания Atos, анонсировала первую систему на базе новейшей графической архитектуры NVIDIA Ampere.

Она будет производиться и поставляться под торговой маркой BullSequana. Машина на основе BullSequana X2415 станет первой в Европе, использующей процессоры NVIDIA A100.

Базовая плата NVIDIA HGX A100, версия с четырьмя ускорителями

Базовая плата NVIDIA HGX A100, версия с четырьмя ускорителями

Вчера NVIDIA представила миру наследницу Turing — микроархитектуру Ampere и первый ускоритель на её основе, A100. Его производительность в традиционных режимах с плавающей запятой составляет 19,5 (FP32) и 9,7 (FP64) Тфлопс, вызывают уважение и показатели на тензорных операциях. Как и V100, A100 является, в первую очередь, вычислительным ускорителем, а не графическим процессором.

Если верить анонсу, вычислительные модули BullSequana X2415 будут более чем вдвое превосходить модели предыдущего поколения, но при этом продемонстрируют более высокую энергоэффективность за счёт применения фирменной жидкостной системы охлаждения DLC (Direct Liquid Cooling).

Машинный зал суперкомпьютера JUWELS

Машинный зал суперкомпьютера JUWELS

Основой новых вычислительных узлов станет плата с двумя процессорами AMD EPYC второго поколения, дополненными 32 Гбайт оперативной памяти. Каждая из ускорительных плат Nvidia HGX A100 получит по четыре ускорителя A100, соединённых между собой шиной NVLink 3.0.

Юлихский исследовательский центр, один из крупнейших научных центров Европы, планирует модернизировать с помощью новых модулей Atos уже имеющийся в его распоряжении суперокомпьютер JUWELS, также произведенный BullSequana. Это сделает JUWELS самым мощным суперкомпьютером на европейском континенте — после модернизации его производительность должна превысить 70 Пфлопс. Система будет использована в ряде научных проектов, включая проект еврокомиссии «Human Brain Project», ей также планируют воспользоваться Юлихские лаборатории климатологии и молекулярных систем.

Nvidia A100, версия NVLink

Nvidia A100, версия NVLink

Массовая доступность BullSequana X2415, насколько этот термин вообще может быть применён к суперкомпьютерам, ожидается во втором квартале текущего года.

Постоянный URL: http://servernews.ru/1011065
06.05.2020 [13:38], Алексей Разин

Cуперкомпьютер Perlmutter получит 6 тысяч GPU NVIDIA и AMD EPYC Milan

Суперкомпьютерная платформа Cray Shasta была представлена ещё в конце 2018 года, но в вычислительном центре NERSC в Беркли суперкомпьютер Perlmutter начнёт монтироваться только в конце текущего года. Помимо прочего, он интересен способностью объединить процессоры AMD Milan и графические процессоры NVIDIA Ampere.

Соответствующий контракт Национальный энергетический научно-исследовательский вычислительный центр (NERSC) заключил с Cray на этой неделе. По условиям контракта, монтаж системы Perlmutter, чей уровень быстродействия приблизится к эксафлопсу, будет проводиться в две фазы.

В следующем полугодии заказчик получит 12 стоек с узлами на основе графических процессоров NVIDIA следующего поколения, а также уникальную подсистему хранения данных на базе твердотельной памяти совокупным объёмом 35 петабайт, способную передавать информацию со скоростью более 5 Тбайт/с. К середине 2021 года будет поставлено 12 стоек с процессорами AMD EPYC семейства Milan.

Источник изображения: NERSC

Источник изображения: NERSC

В принципе, один процессор AMD Milan пропишется и в каждом вычислительном узле, сочетающем четыре графических процессора NVIDIA следующего поколения и 256 Гбайт памяти. В общей сложности, суперкомпьютер Perlmutter будет использовать более шести тысяч графических процессоров NVIDIA следующего поколения. Их условное обозначение не раскрывается, но принято считать, что речь идёт об Ampere с памятью типа HBM2.

Источник изображения: Twitter, Retired Engineer

Источник изображения: Twitter, Retired Engineer

Каждый узел «первой фазы» будет использовать по четыре канала интерконнекта Cray Slingshot, который обладает пропускной способностью 200 Гбит/с. Один «лезвийный» сервер разместит по два узла на базе GPU, либо по четыре узла на базе центральных процессоров AMD EPYC. В последнем случае пара процессоров будет соседствовать с 512 Гбайт памяти. Количество узлов на основе AMD EPYC в суперкомпьютере Perlmutter сможет превысить три тысячи штук.

Действующий суперкомпьютер Cori в NERSC используется более чем семью тысячами учёных для расчётов в сфере энергетики, материаловедения, физики, химии, биологии и предсказания климатических изменений. Perlmutter окажется в три или четыре раза производительнее Cori.

Постоянный URL: http://servernews.ru/1010254
02.05.2020 [21:02], Алексей Степин

Суперкомпьютер Summit вошёл в список Graph500, задействовав половину своих возможностей

Граф — важное понятие в математике и информационных технологиях, позволяющее удобно описывать взаимные связи между множеством объектов. Неудивительно, что существует отдельный рейтинг Graph500, оценивающий производительность суперкомпьютеров именно на операциях с графами.

Суперкомпьютер Summit, смонтированный в Национальной лаборатории Ок-Ридж и занимающий первую строчку в списке TOP500, дебютировал и в Graph500 — впервые в своей истории. При этом он доказал высокую эффективность в задачах подобного рода.

Summit, он же OLCF-4, уже доказал своё право на лидерство в TOP500 и подтвердил высокую эффективность своей гибридной архитектуры, основой которой являются два типа процессоров: IBM POWER9 и NVIDIA Tesla V100. В свежей версии Summit сумел  сразу же занять четвёртое место. Это весьма достойный результат.

Основой тестов Graph500 служит задача о вычислении графа с более чем миллиардом вершин, между которыми имеется примерно 16 миллиардов связей. Для решения данной задачи в Summit задействовалось 86016 процессорных ядер — речь идёт только о традиционных процессорах, но не о ГП-ускорителях. Это примерно 45% всех мощностей суперкомпьютера. Для сравнения, лидер этого списка, китайский суперкомпьютер Sunway TaihuLight использовал свыше 10 миллионов вычислительных ядер (точное число — 10599680 ядер).

Главный соперник Summit, Sunway TaihuLight

Главный соперник Summit, Sunway TaihuLight

Таким образом, удельная производительность Summit оказалась существенно выше, что объяснимо как большей архитектурной сложностью POWER9 в сравнении с достаточно простой RISC-архитектурой процессоров Sunway SW26010, так и более высокой эффективностью межузловых подсистем связи суперкомпьютера. Любопытно, что 2 и 3 места принадлежат системам c процессорами IBM, это машины Blue Gene/Q, установленные в Аргоннской национальной лаборатории и Ливерморской национальная лаборатории им. Э. Лоуренса (LLNL).

Постоянный URL: http://servernews.ru/1009975
28.04.2020 [16:13], Николай Хижняк

Специализированный суперкомпьютер Anton 2 займется поиском лекарств от коронавируса

Специализированный суперкомпьютер Anton 2, разработанный лабораторией D. E. Shaw Research и установленный в Питтсбургском суперкомпьютерном центре (Pittsburgh Supercomputing Center, PSC), стал доступен для специалистов, занимающихся поиском методов лечения коронавирусной инфекции.

Система способна проводить моделирование механики биохимических молекулярных взаимодействий с молекулами потенциальных лекарственных препаратов.

Эта информация является крайне важной для понимания особенностей нового коронавируса, вызвавшего пандемию COVID-19. Кроме того, она может существенно ускорить поиск и разработку новых эффективных методов лечения, профилактики и, возможно, вакцины от нового коронавируса.

Суперкомпьютер Anton 2 был разработан специально с целью моделирования молекулярной динамики белков, нуклеиновых кислот, липидов и других видов молекул. Система способна проводить эту работу в среднем в четыре раза быстрее и может моделировать движения молекулярных систем примерно в пять раз большего размера по сравнению с классическими суперкомпьютерами.

Высокий уровень производительности Anton 2 даст учёным возможность проведения длительного моделирования и наблюдения за сложными биомолекулярными системами, а также их взаимодействием с природными сигнальными молекулами и частицами препаратов-кандидатов.

Доступ к суперкомпьютеру Anton 2 предоставляется американским исследовательским командам для некоммерческих исследований на безвозмездной основе благодаря финансовой поддержке Национальных институтов здравоохранения США.

Заявки на использование суперкомпьютера Anton 2 в Питтсбургском суперкомпьютерном центре принимаются через консорциум High Performance Computing (HPC) Consortium. Им же устанавливается время использования суперкомпьютера для исследований вопросов, связанных с COVID-19.

Постоянный URL: http://servernews.ru/1009633
Система Orphus